Войната срещу роботите сайлони завършва с пълен погром на човешката раса и оцелелите трябва да се оттеглят от Дванадесетте колонии. Тези, които са останали, са предвождани от президента Лора Розлин и командир Уилиам Адама, които ги качват на мощен, но стар космически кораб. Оцелелите няма къде друга да се спасят, освен на мистичната Тринадесета колония, наречена „Земя“, която обаче тепърва трябва да бъде намерена, докато по петите на малкото оцелели са сайлонските войници. В началото на втори сезон командир Адама умира и остава Тиг начело на командването. Опасен сайлонски вирус атакува захранването на „Галактика“. Новият командир има проблем с дисциплината, а президента Розлин губи контрол. Скоро изгнаниците ще попаднат и на други представители на човешката раса.