Този сериал от 13 епизода разказва историята на именития магьосник на крал Артур Мерлин. В митичния град Камелот още преди той да стане известен като мястото на рицарите на кръглата маса, живеят хора, зверове и митични създания. В този свят обаче магията е забранена от тиранина Утър Педрагон.

Когато млад мъж на име Мерлин пристига в града, той бързо си спечелва много врагове заради мистичните и невероятни сили, които притежава. Сред враговете е и наследника на Утър принц Артур. С помощта на един лекар на име Гайъс Мерлин ще успее да започне да използва талантите си не само, за да оцелява, но и за да отключи тайните на Камелот.

Първото нещо, което ще открие Мерлин, че съдбата му е близко свързана с младия Артур.